Ratusan jenis begonia itu ditanam secara khusus di sebuah Taman Begonia seluas 700 meter persegi. Kabarnya, koleksi begonia yang ada di Kebun Raya Eka Karya Bedugul tersebut merupakan yang terlengkap di dunia. Untuk diketahui jumlah spesies Begonia mencapai lebih dari 1.700 di dunia dan tersebar di kawasan tropis maupun sub tropis.
Di Indonesia sendiri, diperkirakan ada lebih dari 200 jenis begonia. Mengutip laman LIPI, di Jawa terdapat 15 jenis begonia, di Sumatra 35 spesies, Kalimantan 40 spesies, Sulawesi 20 spesies dan di Papua sebanyak 70 spesies.
Pengoleksian Begonia dai Kebun Raya Eka Karya Bedugul diawali pada 2001 silam. Selang 7 tahun kemudian, sebuah tulisan Hoover (2008) pada World Center of Begonia menyebut Kebun Raya Bali memiliki koleksi begonia terlengkap di dunia. Padahal, awalnya kebun raya yang berada pada ketinggian 1.250 mdpl itu hanya memulai pengoleksian dengan 5 jenis begonia saja.
Penambahan koleksi terbanyak dilakukan pada 2006 hingga 2009 yang berasal dari eksplorasi di Pulau Sulawesi dan Papua. Khusus eksplorasi di Papua, dilakukan di Cagar Alam Pulau Batanta Barat, Kabupaten Raja Ampat, Papua Barat.
Selain dengan eksplorasi flora ke sejumlah pulau, upaya memperkaya koleksi juga dilakukan dengan pertukaran biji ke kebun raya lain. Ada pun kebun raya yang sempat diajak berkerjasama untuk memperkaya koleksi tersebut, antara lain Jardin Botanic Garden (BG), Perancis; Glassgow BG, Skotlandia; Queen Sirikit BG, Thailand; Tubingen BG, Jerman; American Begonia Society Tonkawa, Amerika Serikat; dan New England Tropical Conservatory, Inggris.
Sementara itu, dari 313 jenis begonia yang ada di Kebun Raya Eka Karya Bali tersebut, 100 diantaranya merupakan begonia alam, sedangkan 213 sisanya merupakan begonia hasil persilangan.
